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L’assainissement se réfère à l’amélioration de la situation sanitaire globale de l’environnement à travers le traitement et à l’élimination adéquate des excréments humains et des eaux usées. En Afrique, l’assainissement prend une dimension particulière puisqu’il est au cœur des politiques de santé publique avec notamment la lutte contre la défécation en plein air à l’origine des maladies comme le choléra.

D’un point de vue environnemental, l’assainissement en Afrique renvoie à la lutte contre la pollution causée par les eaux usées, avec la construction des stations d’épuration. Dans certaines parties de l’Afrique, l’assainissement intègre également la réutilisation des eaux usées pour l’irrigation ou encore la consommation des populations dans des pays aux ressources en eau douce limitées comme la Namibie.